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基于国际领先的蛋白质谱数据库搜索结果评估工具Scaffold，着重介绍如何根据目前三大主要的蛋白质谱搜索引擎Mascot、SEQUEST和X!Tandem的分析结果，进行合理的评估和整合，从而大大增加蛋白质谱鉴定的准确性和客观性，帮助用户更好更全面地理解质谱分析的结果。
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