实验动物的遗传质量对动物实验结果有重要影响。近交系小鼠是医学生物学研究中广泛应用的实验动物，其本身的质量尤其是个体基因的纯合性与不同个体遗传一致性对实验结果的可比性、可重复性和准确性起着决定性作用。

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MSAP可以检测不同样本基因组DNA甲基化的差异，通过不同限制酶识别甲基差异的特性来获得差异扩增片段的一种分子标记，是AFLP方法的延伸。

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